В ходе обследования Тавдинской пещеры на Алтае были найдены фрагменты керамики, предварительно датируемой эпохой бронзы и раннего железного века (Вистингаузен В. К., 1998). Как отмечает В.К. Вистенгаузен (в статье 1998 г.) вверхней части пещеры заметны следы 2 довольно старых шурфов, по его мнению это следы раскопок М.И. Крота (Вистингаузен В. К., 1998). В августе 1981 года, при посещении пещеры В.К. Вистенгаузентакже нашел на полу "Нижней галереи" 4 фрагмента керамики. В.К. Вистенгаузен приводит описание керамики «Вся керамика лепная, толстостенная. Фрагмент из входа - красно-коричневого цвета, хорошо обожжен, тесто с примесью дресвы. На изломе -след сквозного отверстия. Есть Находки - 2 фрагмента, аналогичные вышеописанному, у одного с внутренней стороны есть следы нагара. Третий (обломок венчика) - единственный, по которому можно судить о форме сосуда. Видимо, это горшок со слабо выраженной шейкой. Венчик плоский вверху, край его отогнут наружу.
По шейке идет орнаментальный пояс из неглубоких овальных вдавлений, расположенных наклонно, под углом друг к другу (сохранилось два вдавления). Тесто с примесью дресвы, обжигсреднего качества, цвет - серовато-коричневый. Три первых фрагмента датируются ранним железным веком, а обломок венчика - эпохой бронзы» (Вистингаузен В. К., 1998 стр. 49-50). В.К Вистенгазенн высказал предположение, что в древности «скорее всего пещера являлась святилищем» (Вистингаузен В. К., 1998 стр. 50). В 1626 г. Появилась первая статья М.И. Крот-Донорского о пещере, которую он исследовал в 1920 г., будучи директором Бийского музея.
Эта первая, собственно, спелеологическая работа по Алтаю сопровождалась первым планом пещеры, довольно хорошо выполненным. М.И. Крот сделал в пещере археологические находки. В пещере были обнаружены следы обитания людей, либо в пещере кто-то укрывался во время гражданской войны, либо там ранее скрывались пустынники старообрядцы. В 1960 г. была организована первая группа спелеологов и карстоведов Горно-Алтайска, Новосибирска, Томска, Новокузнецка, Барнаула. Однако новых публикаций не последовало.
В 1968 г. пещера была исследована объединенной группой Карстового отряда ЗСГУ (нач.Г.П. Шарихина) и третьей Алтайской экспедиции спелеологической секции ТГУ (рук. В.Чуков). Были приняты попытки найти писаниц внутри пещеры. К сожалению поиски были безуспешными. Информацию, что в Тавдинской пещере (или на скалах рядом с пещерой) имеются выполненные охрой наскальные рисунки древнего человека, в разные годы получали археологи А.П. Окладников, В.Д. Кубарев, музейные работники Б.Х. Кадиков и С.С. Зяблицкий. Стены и потолок пещеры преимущественно ровные без выступов. Пол пещеры покрыт красновато-желтым паттумом, достаточно рыхлым и сухим, практически без примеси щебня. На потолке пещеры мы наблюдаем белые наплывы (сталактиты). Сталактиты растут в год на 1 см. К сожалению, мы не можем увидеть больших сталактитов, т.к. они были обломаны туристами. 1920 г. М.И. Крот обнаружил в пещере колодец, длина колодца составляла 4м.
На дне он обнаружил 2 каменные лежанки, на которых предположительно спали древние люди. Лежанки представляли собой каменные плиты 2 м длинной и 1 м шириной. Пройдя по пещере 70 м, можно обнаружить узкий туннель, его длина составляет 15 м, по которому приходится идти, пригнувши голову. Выйдя из туннеля, есть большой зал, который пользуется особой популярностью у туристов и называется «Орлиный грот». В этом зале были обнаружены кости окаменевшей птицы. До сих пор остается загадкой, как эта птица туда попала, т.к. этим костям около 2 тысяч лет.
При подъеме по лестнице, обнаруживается тупик, его длина составляет 8м, по мнению ученых именно в этом тупике жгли костер древние люди, т.к. на полу была обнаружена зола. После ряда испытаний путем разжигания костра на потолке было обнаружено сквозное отверстие, которое служило людям, жившим в этой пещере природным дымоходом. Длина дымохода составляет 40 м. Гипотеза о том, что в этой пещере жили люди, полностью подтвердилась. В простонародье эту пещеру называют «Девичьи слезы».